Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms