Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r88E9Q235 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms