Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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