Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp558E9Q1J0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zfp558E9Q1J0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zfp558E9Q1J0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zfp558E9Q1J0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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