Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms