Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms