Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brd1E9PZ26 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms