Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms