Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms