Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms