Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms