Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms