Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp839E9PUU5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms