Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms