Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms