Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.7 ms