Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms