Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SafbD3YXK2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms