Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms