Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms