Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms