Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms