Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt4B2RU40 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms