Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms