Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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AU022751B1B0V2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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AU022751B1B0V2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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AU022751B1B0V2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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AU022751B1B0V2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AU022751B1B0V2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU022751B1B0V2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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