Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930402K13RikB1AW18 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms