Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms