Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3173A6NAS3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms