Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll2A4Q9E4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll2A4Q9E4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms