Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pm20d2A3KG59 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pm20d2A3KG59 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms