Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms