Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Samt1A2BED8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms