Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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