Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll9A2APC3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms