Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms