Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a3A2ACT7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms