Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms