Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myom3A2ABU4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms