Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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