Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms