Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb4A2A863 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms