Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms