Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms