Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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