Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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