Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms