Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms