Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms