Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt16Q9Z2K1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt16Q9Z2K1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt16Q9Z2K1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt16Q9Z2K1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt16Q9Z2K1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt16Q9Z2K1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms