Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms